More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0472 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  100 
 
 		 380 aa  762    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  54.55 
 
 		 373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  52.3 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  47.17 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  52.56 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  53.72 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  46.67 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  47.04 
 
 		 373 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  46.63 
 
 		 373 aa  362  8e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  45.82 
 
 		 386 aa  358  6e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  53.93 
 
 		 369 aa  358  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  45.82 
 
 		 386 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  46.51 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  46.49 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  48.77 
 
 		 379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  48.57 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  47.43 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  44.05 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  43.67 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  44.99 
 
 		 392 aa  328  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  50.26 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  46.76 
 
 		 371 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  44.02 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  42.2 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  45.14 
 
 		 370 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  42.97 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  43.2 
 
 		 389 aa  315  9e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  42.7 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  42.7 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  42.7 
 
 		 391 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  42.7 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  42.7 
 
 		 391 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  42.7 
 
 		 391 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  41.89 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  41.89 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  41.73 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  41.35 
 
 		 408 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  44.5 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  45.26 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  44.29 
 
 		 375 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  42.44 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  41.55 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  41.29 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  42.63 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  42.36 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  43.85 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  42.09 
 
 		 389 aa  278  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  41.67 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  41.67 
 
 		 389 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  41.67 
 
 		 389 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  41.4 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  42.59 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  41.4 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  40.97 
 
 		 395 aa  276  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  41.4 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  41.4 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  43.13 
 
 		 378 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  41.4 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  43.97 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  41.51 
 
 		 395 aa  271  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  41.02 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  39.35 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  41.67 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  41.67 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  44.83 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  41.44 
 
 		 365 aa  264  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  39.25 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  44.11 
 
 		 811 aa  262  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  40.38 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  42.54 
 
 		 851 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  44.03 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  43.77 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  43.5 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40.17 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  38.81 
 
 		 376 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  38.32 
 
 		 369 aa  252  6e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  39.37 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  39.84 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  40.92 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  39.08 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  41.29 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  40.48 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  39.15 
 
 		 434 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  44.17 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1888  alanine racemase  43.62 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  40.38 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  40.9 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  40.59 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  39.19 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  41.64 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  43.97 
 
 		 376 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  41.62 
 
 		 402 aa  235  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  39.47 
 
 		 834 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  40.37 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  43.56 
 
 		 849 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  40.37 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  35.73 
 
 		 374 aa  232  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  35.73 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  35.68 
 
 		 369 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  37.04 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>