74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0194 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0194  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
528 aa  1087    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00079509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1825  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 
505 aa  231  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0936  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 
506 aa  200  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.26189  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0395  hypothetical protein  27 
 
 
515 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1198  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0909  beta-lactamase-like  25.05 
 
 
502 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.79696  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0773  hypothetical protein  34.55 
 
 
367 aa  150  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000921775  hitchhiker  0.000000000779412 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1189  vesicle-fusing ATPase  31.25 
 
 
344 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.405449  normal  0.0544197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1225  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.11 
 
 
354 aa  54.3  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  23.76 
 
 
258 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  26.34 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 
371 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
246 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
242 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 
321 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
330 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  31.52 
 
 
403 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 
366 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 
302 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  24.9 
 
 
272 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
308 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 
273 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  31.17 
 
 
238 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
247 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 
206 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 
306 aa  47.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 
329 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 
452 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  25.88 
 
 
304 aa  47.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  30.43 
 
 
403 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  23.2 
 
 
324 aa  47  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  30.43 
 
 
403 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  26.18 
 
 
352 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  24.06 
 
 
348 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  33.78 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  30.43 
 
 
403 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
240 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 
288 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
209 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  25.5 
 
 
325 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  24.87 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
340 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
305 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
326 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  23.2 
 
 
339 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
237 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 
354 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 
287 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  28.87 
 
 
405 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
209 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 
205 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
213 aa  44.3  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
256 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  23.96 
 
 
403 aa  43.9  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  23.2 
 
 
404 aa  43.5  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  23.03 
 
 
307 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
307 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 
215 aa  43.9  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 
215 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
243 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  25.83 
 
 
215 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  28.8 
 
 
219 aa  43.5  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  22.62 
 
 
404 aa  43.5  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  25.83 
 
 
215 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 
328 aa  43.5  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
301 aa  43.5  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 
215 aa  43.5  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 
215 aa  43.5  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 
215 aa  43.5  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>