36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0354 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 108 aa  216  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  62.75 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  55.88 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  53.47 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  54.08 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  52.48 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  54.08 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  50.51 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  51 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  49 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  45 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  45.28 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  33.01 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  32.61 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3254  hypothetical protein  35.87 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185219 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01282  glutamine-rich cytoplasmic protein (Eurofung)  44.62 
 
 		 347 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 586 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  31.43 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  31.43 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 591 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  31.43 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  28.26 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 103 aa  43.5  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1254  tetratricopeptide TPR_2  34.33 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3761  hypothetical protein  27.17 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0655418  hitchhiker  0.00103687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.92 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 589 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2293  tetratricopeptide TPR_2  42.86 
 
 		 384 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  31.67 
 
 		 729 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10215  peroxisomal targeting signal (PTS1) receptor protein peroxin 5 (Eurofung)  36.54 
 
 		 655 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000612411  normal  0.654696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>