More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5049 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 436 aa  872    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  66.75 
 
 		 427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  66.75 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  66.98 
 
 		 427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  66.75 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  66.51 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  66.51 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  66.75 
 
 		 446 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  65.48 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  64.72 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  63.96 
 
 		 421 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  63.72 
 
 		 421 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  66.59 
 
 		 421 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  64.44 
 
 		 421 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  65.18 
 
 		 429 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  65.87 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  64.69 
 
 		 427 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  64.92 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  64.92 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  64.92 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  64.92 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  64.68 
 
 		 421 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  64.92 
 
 		 421 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  64.99 
 
 		 421 aa  534  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  64.2 
 
 		 421 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  63.72 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  65.23 
 
 		 421 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  62.32 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  63.31 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2119  4-aminobutyrate aminotransferase  66.04 
 
 		 427 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  63.07 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  62.77 
 
 		 421 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0494  4-aminobutyrate transaminase  65.8 
 
 		 427 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141268  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1480  4-aminobutyrate aminotransferase  65.8 
 
 		 427 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285314  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0810  4-aminobutyrate transaminase  65.8 
 
 		 427 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.622888  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3106  4-aminobutyrate aminotransferase  60.33 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1335  4-aminobutyrate aminotransferase  60.33 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1218  4-aminobutyrate aminotransferase  60.33 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  64.99 
 
 		 426 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0396  4-aminobutyrate transaminase  65.57 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.925328  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1822  4-aminobutyrate transaminase  65.57 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2127  4-aminobutyrate transaminase  65.57 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  60.74 
 
 		 440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  62.68 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  63.04 
 
 		 422 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  62.62 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  58.39 
 
 		 426 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  58.63 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  61.19 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  62.35 
 
 		 426 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  61.87 
 
 		 426 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  59.71 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  59.71 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  57.65 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  56.91 
 
 		 428 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2341  4-aminobutyrate aminotransferase  59 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  59.9 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  53.77 
 
 		 425 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  53.77 
 
 		 425 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  52.14 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  55.95 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  55.37 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  54.99 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  56.37 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  53.54 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  54.35 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  54.59 
 
 		 426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  55.48 
 
 		 424 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  51.67 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  57.67 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  52.52 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  53.77 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2602  4-aminobutyrate aminotransferase  55.24 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  57.14 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  53.92 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  55.8 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  53.63 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  53.43 
 
 		 425 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  54.76 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4286  4-aminobutyrate aminotransferase  55.71 
 
 		 425 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.012329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  54.59 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  53.4 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  54.35 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  52.12 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  52.25 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  54.96 
 
 		 427 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  54 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  50.59 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  50.35 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  50.59 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  51.92 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  50.59 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  50.59 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  53.64 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  51.92 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  50.59 
 
 		 426 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  50.59 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  51.68 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  50.12 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  51.68 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
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