94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4646 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4646  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50710  ABC type tungstate transporter, permease component  51.67 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1482  tungstate ABC transporter permease  32.48 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0301515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2399  ABC-type tungstate transport system, permease component  30.59 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000226996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2093  signal peptide protein  30.81 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0931  signal peptide protein  29.12 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3544  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  28.63 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000241065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0895  putative signal peptide protein  27.56 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1459  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  25.64 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1630  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  27.35 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.883848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2738  ABC-type tungstate transport system, permease component  31.42 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653631  normal  0.74961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1451  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  32.67 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2852  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2970  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3078  extracellular solute-binding protein family 1  29.77 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2398  hypothetical protein  23.88 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1778  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.65 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0124  putative sulfate transport system substrate-binding protein  28.26 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1650  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.87 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2084  molybdate-binding protein  28.18 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1542  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.455617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2763  ABC-type tungstate transport system, permease component  28.57 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1920  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0628  basic organic compound ABC-transporter  29.38 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1543  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  29.55 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2435  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149847  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4094  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2301  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000829755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1693  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  24.78 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0067  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000233722  normal  0.143778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4457  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1542  ABC-type tungstate transport system, solute-binding protein  25.62 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00118564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4262  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4317  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0234  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2700  tungstate ABC transporter, periplasmic tungstate-binding protein, putative  26.11 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0082  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2225  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.46 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4719  hypothetical protein  25.39 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3967  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4077  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1793  ABC-type tungstate transport system permease component-like  24.9 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3874  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1130  hypothetical protein  25.95 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0027  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0472566  normal  0.160899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3879  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.225876  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1204  ABC transporter tungsten-binding protein  28.43 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1511  hypothetical protein  26.47 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6165  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.970224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3706  molybdate or tungstate transport  30.37 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3623  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2867  hypothetical protein  25.59 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4040  tungstate ABC transporter permease  22.46 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.570909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1386  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1401  extracellular tungstate binding protein precursor  22.22 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1336  putative sulfate transport system substrate-binding protein  25 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2528  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  23.83 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00294205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5505  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1590  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0039  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.68 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000295564  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3032  sulfate/tungstate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.25 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.425181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1815  hypothetical protein  29.65 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000089801 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27140  ABC-type tungstate transport system, permease component  26.6 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2221  hypothetical protein  27.96 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.339438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003504  ABC-type tungstate transport system binding protein  24.32 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3917  putative sulfate transport system substrate-binding protein  24.75 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000121596  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 636 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1041  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000090401  hitchhiker  0.000000000362846 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2057  molybdate transport protein  26.97 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0596922  normal  0.120456 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.62 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0087  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0329  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000162335  normal  0.17171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02264  hypothetical protein  24.86 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3683  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2631  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.32 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.084479  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0964  binding protein, putative  31.33 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00257084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2780  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.95 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0195  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3402  hypothetical protein  22.33 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0473  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  23.62 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0443  molybdate-binding protein  22.66 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.853426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3454  molybdate transport protein  24.21 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1877  ABC transporter tungsten-binding protein  30 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0465  hypothetical protein  23.12 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1760  hypothetical protein  24.44 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0986802 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3309  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.58 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2296  ABC-type tungstate transport system permease component-like protein  27.59 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0614  putative sulfate transport system substrate-binding protein  22.67 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.582786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0675  ABC-type tungstate transport system, permease component  25 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.4223499999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0046  binding protein, putative  29.33 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.768713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3944  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0124  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1892  ABC transporter tungsten-binding protein  22.45 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>