More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3597 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  75.11 
 
 		 222 aa  340  9e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  75.57 
 
 		 222 aa  340  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  75 
 
 		 222 aa  332  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  68.78 
 
 		 222 aa  308  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  67.87 
 
 		 212 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  66.06 
 
 		 216 aa  288  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  62.9 
 
 		 213 aa  280  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  59.19 
 
 		 215 aa  254  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  58.37 
 
 		 213 aa  252  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  57.85 
 
 		 214 aa  246  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  56.95 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  53.64 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  53.18 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  55.61 
 
 		 215 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  54.71 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  56.05 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  53.36 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  53.36 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  53.36 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  52.94 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  52.91 
 
 		 214 aa  221  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  54.03 
 
 		 216 aa  221  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  52.91 
 
 		 214 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  52.02 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  52.47 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  52.91 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  49.33 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  51.12 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  51.12 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  51.12 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  51.12 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  51.11 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  50.67 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  50.22 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  52.94 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  50.22 
 
 		 216 aa  208  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  48.87 
 
 		 215 aa  208  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  50.46 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  48 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  48.03 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  50.67 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  50.67 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  51.11 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  50.67 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  48.44 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  45 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  50.67 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  50.9 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 222 aa  201  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  51.23 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  46.58 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  50.96 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 		 216 aa  197  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  50.96 
 
 		 214 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  45.61 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  50.96 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  48.4 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  46.12 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  47.98 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  48 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  45.09 
 
 		 212 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  45 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  47.06 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  47.27 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  43.12 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  42.66 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  43.95 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  43.64 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  46.58 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  46.36 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  45 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  51.58 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  49.28 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  48.86 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  48.18 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  46.82 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  47.27 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  47.03 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  45.91 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  45.91 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  45.91 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  44.33 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  46.4 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  45.7 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  48.36 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  43.89 
 
 		 211 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  45 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  47.27 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  46.36 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  46.7 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  43.38 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  44.55 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>