More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2514 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2514  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 457 aa  890    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0701  xanthine/uracil permease family protein  45.35 
 
 		 435 aa  349  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  29.89 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  30.43 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  30.2 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  30.19 
 
 		 825 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  32.16 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  29.58 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  32.62 
 
 		 413 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  32.4 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  32.3 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  31.4 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  32.2 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  32.39 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  31.38 
 
 		 459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  31.74 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  31.24 
 
 		 487 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  31.91 
 
 		 413 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  30.4 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  31.05 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  29.68 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  31.44 
 
 		 446 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  29.78 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  31.17 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  31.97 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  31.57 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  30.95 
 
 		 466 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  28.84 
 
 		 449 aa  173  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  33.05 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  33.03 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  29.67 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  34.34 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  30.72 
 
 		 458 aa  169  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  30.02 
 
 		 457 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  30.32 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  28.41 
 
 		 460 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  29.82 
 
 		 503 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  28.98 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  28.41 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  29.55 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  31.88 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  30.14 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  31.28 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  30.34 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1309  Xanthine/uracil permease  30.94 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00197381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  30.7 
 
 		 465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  27.6 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  27.6 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  27.6 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  27.6 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  27.6 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  27.6 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  27.6 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  28.22 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  27.38 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  29.71 
 
 		 640 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  29.02 
 
 		 633 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  28.88 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  27.99 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  27.7 
 
 		 440 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  29.89 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  28.31 
 
 		 495 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  28.94 
 
 		 461 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  28.94 
 
 		 472 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  29.05 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  30.02 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  30.02 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  30.02 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  30.02 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  30.02 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  29.63 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  29.63 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  29.12 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  28.1 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  30.56 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  29.46 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  27.58 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  27.89 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  30.77 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  29.1 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  27.49 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000668836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  29.1 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0933  xanthine/uracil permease  29.26 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  29.37 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  29.37 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  29.37 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  29.37 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  29.37 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  29.37 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  29.37 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  28.35 
 
 		 458 aa  156  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  29.54 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  29.16 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  32.47 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  28.22 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  29.67 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  28.22 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  28.22 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  29.83 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  29.16 
 
 		 463 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>