147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1186 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1186  urease accessory protein UreD  100 
 
 		 305 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2188  Urease accessory protein UreD  49.01 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2036  urease accessory protein ureD  50.68 
 
 		 295 aa  265  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.133178  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1865  Urease accessory protein UreD  48.68 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0991  urease accessory protein UreD  50.87 
 
 		 289 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.271998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0957  urease accessory protein UreD  49.66 
 
 		 293 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0865404  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2256  urease accessory protein UreD  45.86 
 
 		 293 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2181  urease accessory protein UreD  45.1 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3132  UreD-family accessory protein  45.1 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0727  urease accessory protein UreD  45.1 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2560  urease accessory protein UreD  45.1 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3072  urease accessory protein UreD  45.1 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3108  urease accessory protein UreD  45.1 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.890859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2053  urease accessory protein UreD  45.1 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1499  urease accessory protein UreD  44.52 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4009  urease accessory protein UreD  45.76 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0949  Urease accessory protein UreD  44.86 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3688  putative urease accessory protein  43.96 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2487  urease accessory protein UreD  45.95 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0873  urease accessory protein UreD  46.1 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0793  urease accessory protein UreD  45.76 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0782  urease accessory protein UreD  45.76 
 
 		 291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0903  urease accessory protein UreD  45.08 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1197  urease accessory protein UreD  39.66 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.294974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1430  urease accessory protein UreD  42.95 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0424  urease accessory protein UreD  44.75 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09910  Urease accessory protein UreD  43.75 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2883  urease accessory protein UreD  41.58 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1770  urease accessory protein UreD  37.93 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0585  urease accessory protein UreD  40.14 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3376  urease accessory protein UreD  42.81 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2996  urease accessory protein UreD  40.4 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1092  urease accessory protein UreD  39.12 
 
 		 278 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2444  urease accessory protein UreD  35.96 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64335  urease accessory protein  41.5 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5585  urease accessory protein  41.5 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2308  urease accessory protein UreD  39.33 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0696  urease accessory protein UreD  41.18 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0879  urease accessory protein UreD  35.96 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4431  urease accessory protein UreD  39.86 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.645112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3101  Urease accessory protein UreD  42.18 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4890  urease accessory protein UreD  38.41 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1004  urease accessory protein UreD  38.7 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1238  urease accessory protein UreD  36.03 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0181  urease accessory protein UreD  38.49 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.31708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2414  urease accessory protein UreD  37.04 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.406296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3971  Urease accessory protein UreD  38.44 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2938  urease accessory protein UreD  37.37 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1414  urease accessory protein UreD  39.12 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0742  UreD-family accessory protein  44.49 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.16649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2842  urease accessory protein UreD  38.23 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2847  urease accessory protein UreD  37.71 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3936  Urease accessory protein UreD  38.1 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1390  urease accessory protein UreD  39.93 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.469833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3463  urease accessory protein UreD  35.17 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000478315  normal  0.195729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3622  urease accessory protein UreD  33 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2273  Urease accessory protein UreD  35.52 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1082  urease accessory protein UreD  40.07 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0218  urease accessory protein D  33.12 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.842987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0953  urease accessory protein UreD  31.58 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00886  putative urease accessory protein UreD  28.99 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2991  urease accessory protein UreD  31.75 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.866149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1799  urease accessory protein UreD  37.34 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3505  urease accessory protein UreD  35.78 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1024  urease accessory protein UreD  31.46 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4154  urease accessory protein UreD  33.7 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2062  Urease accessory protein UreD  28.28 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000769283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1707  Urease accessory protein UreD  31.71 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605089 
 
 
-
 
NC_004310  BR0267  urease accessory protein UreD  34.34 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.628784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0281  urease accessory protein UreD  34.34 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4186  Urease accessory protein UreD  42.64 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0989  urease accessory protein UreD  25.96 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1052  urease accessory protein UreD  28.05 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0397  Urease accessory protein UreD  32.46 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585213  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19231  urease accessory protein UreD  30.12 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2624  urease accessory protein D  28.81 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.829261  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2469  urease accessory protein UreD  39.31 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7013  putative urease accessory protein UreD  35.62 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3486  urease accessory protein  37.59 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3245  Urease accessory protein UreD  41.09 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3020  urease accessory protein UreD  40.31 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29781  urease accessory protein UreD  27.86 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1212  urease accessory protein UreD  41.12 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2014  Urease accessory protein UreD  28.66 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3209  Urease accessory protein UreD  33.02 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0331  urease accessory protein UreD  32.91 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2214  urease accessory protein UreD  32.39 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280053 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0833  urease accessory protein UreD  29.66 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0396  Urease accessory protein UreD  35.1 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3697  urease accessory protein UreD  38.76 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2718  urease accessory protein UreD  28.85 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.274036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3308  urease accessory protein UreD  28.36 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0886683  normal  0.364033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2254  urease accessory protein D  38.98 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08901  urease accessory protein UreD  27.59 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.697976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1683  urease accessory protein UreD  27.85 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4047  urease accessory protein UreD  31.96 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6187  urease accessory protein UreD  35.21 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03480  urease accessory protein UreH  31.05 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2389  urease accessory protein UreD  29.23 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.274527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1555  Urease accessory protein UreD  26.26 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>