67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1404 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1404  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6583  hypothetical protein  52.42 
 
 
237 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0111  hypothetical protein  53.3 
 
 
242 aa  207  9e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.485373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4144  putative permease  53.95 
 
 
232 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.4015  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4194  putative permease  53.95 
 
 
232 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4088  putative permease  53.95 
 
 
232 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4253  hypothetical protein  53.95 
 
 
232 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4073  hypothetical protein  53.49 
 
 
232 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811034  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  40.54 
 
 
223 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1927  hypothetical protein  47.47 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  40.54 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  40.54 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  39.64 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  39.64 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  39.64 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  38.94 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  38.74 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  38.94 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  36.84 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  38.74 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0978  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1011  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  39.39 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1221  protein of unknown function UPF0005  40.78 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2686  protein of unknown function UPF0005  40.78 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2846  hypothetical protein  39.81 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0018864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00974  inner membrane protein  37.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0511489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2148  hypothetical protein  37.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0598762  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1126  hypothetical protein  38.76 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21152e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1194  hypothetical protein  38.76 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2537  hypothetical protein  39.81 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1148  hypothetical protein  38.76 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466231  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1043  hypothetical protein  38.76 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.598631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1160  hypothetical protein  38.76 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.572482  normal  0.332109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1135  hypothetical protein  37.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.53324  normal  0.675558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00981  hypothetical protein  37.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0860489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1084  hypothetical protein  37.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000421704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1078  hypothetical protein  37.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000486786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2626  hypothetical protein  37.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0636098  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2673  protein of unknown function UPF0005  37.98 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  40.2 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2345  hypothetical protein  37.21 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0311475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1767  hypothetical protein  39.81 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000691139  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  27.95 
 
 
283 aa  52.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1482  hypothetical protein  37.98 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00851236  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  38.1 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  32.77 
 
 
233 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  30.26 
 
 
226 aa  52  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  33.66 
 
 
229 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  27.47 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  32.59 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  31.97 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2053  inner membrane protein  34.4 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0952289  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0330  integral membrane protein  37.89 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  31.97 
 
 
222 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  25.91 
 
 
252 aa  45.4  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  32.04 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  29.41 
 
 
222 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1202  carrier/transport protein  37.36 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  33.88 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  33.88 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  33.88 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  25.85 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  33.33 
 
 
233 aa  42  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  35.09 
 
 
238 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  33.06 
 
 
235 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  35.51 
 
 
218 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>