More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5878 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 446 aa  880    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  38.37 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  37.39 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  39 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  37.8 
 
 		 434 aa  296  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  37.74 
 
 		 421 aa  295  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.32 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  37.32 
 
 		 434 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  39.34 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.67 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  41.05 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  38.52 
 
 		 436 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  37.35 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  40.91 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  43.88 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  35.94 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  37.71 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  37.04 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.67 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 465 aa  274  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  35.65 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  37.23 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  36.75 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  35.32 
 
 		 418 aa  259  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  39.67 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  35.41 
 
 		 420 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  36.02 
 
 		 430 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 		 422 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 		 428 aa  256  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  36.73 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  35.81 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  36.83 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  37.77 
 
 		 422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 416 aa  254  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  35.01 
 
 		 418 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 420 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  34.77 
 
 		 418 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 		 418 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 		 418 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  35.95 
 
 		 418 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 418 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 		 418 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2067  glutamyl-tRNA reductase  36.67 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.85694e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2461  glutamyl-tRNA reductase  36.67 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000933086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  35.95 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  38.27 
 
 		 424 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 418 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  36.48 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 416 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  36.52 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  35.34 
 
 		 418 aa  250  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  34.37 
 
 		 418 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  36.48 
 
 		 416 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.94 
 
 		 454 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 426 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  36.22 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.5 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  39.07 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  34.53 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  35.97 
 
 		 416 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  36.68 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  36.2 
 
 		 416 aa  246  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  35.63 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.57 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0919  glutamyl-tRNA reductase  36.48 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  35.66 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3127  glutamyl-tRNA reductase  34.44 
 
 		 416 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000225636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  37.32 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 443 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 425 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2180  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 438 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00403267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 		 425 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  34.26 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  36.32 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  33.26 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>