32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5503 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
491 aa  929    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 
523 aa  74.3  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.41 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 
486 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  30.98 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
444 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 
435 aa  58.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
451 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  20.32 
 
 
444 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 
542 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 
526 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  23.17 
 
 
483 aa  53.5  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  31.15 
 
 
529 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  26.1 
 
 
473 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 
511 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  24.33 
 
 
471 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.82 
 
 
470 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 
472 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 
473 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
449 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
482 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 
486 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>