36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0248 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  50 
 
 		 2851 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  41.57 
 
 		 366 aa  52.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  40 
 
 		 1426 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  51.67 
 
 		 2914 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  35.71 
 
 		 382 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  56.36 
 
 		 587 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  47.22 
 
 		 839 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  40.78 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  52.08 
 
 		 730 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  34.71 
 
 		 437 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  34.71 
 
 		 437 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  57.45 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  51.06 
 
 		 493 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  63.83 
 
 		 813 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  53.19 
 
 		 451 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  51.06 
 
 		 492 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  49.09 
 
 		 400 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.98 
 
 		 689 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  60.42 
 
 		 442 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  59.62 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  35.65 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  35.65 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 582 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  52.73 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5441  Collagen triple helix repeat protein  64.1 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  57.45 
 
 		 478 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  40.43 
 
 		 645 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  57.45 
 
 		 481 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  61.7 
 
 		 712 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  43.48 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  60 
 
 		 643 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 		 158 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1120  hypothetical protein  43.48 
 
 		 198 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  38.36 
 
 		 857 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  61.9 
 
 		 344 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>