66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6959 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  100 
 
 
261 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1615  hypothetical protein  55 
 
 
287 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1702  protein of unknown function DUF191  56.15 
 
 
276 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2176  hypothetical protein  56.15 
 
 
276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1773  protein of unknown function DUF191  55.38 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4152  protein of unknown function DUF191  49.25 
 
 
281 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  48.24 
 
 
277 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  47.84 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  47.86 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0686  hypothetical protein  47.08 
 
 
277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  48.05 
 
 
278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  49.02 
 
 
288 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0599  protein of unknown function DUF191  48.63 
 
 
288 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000197308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  46.51 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  46.72 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  46.67 
 
 
272 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  44.71 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1815  hypothetical protein  46.88 
 
 
279 aa  234  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  44.88 
 
 
279 aa  231  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  44.57 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  43.53 
 
 
297 aa  218  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0552  hypothetical protein  42.47 
 
 
307 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00285947  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1278  protein of unknown function DUF191  42.69 
 
 
285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  42.59 
 
 
304 aa  208  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  43.19 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4337  hypothetical protein  39.64 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3946  hypothetical protein  39.29 
 
 
320 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  39.92 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8091  protein of unknown function DUF191  40.84 
 
 
272 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0151  hypothetical protein  40.54 
 
 
293 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0137772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  36.05 
 
 
291 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4422  hypothetical protein  40.54 
 
 
281 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928924  normal  0.490091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4199  protein of unknown function DUF191  41.6 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0260  hypothetical protein  40.98 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  34.38 
 
 
280 aa  178  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3234  hypothetical protein  38.58 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  36.19 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  32.69 
 
 
275 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  34.75 
 
 
280 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  32.56 
 
 
267 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111813 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0462  hypothetical protein  32.03 
 
 
268 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.104402  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0830  hypothetical protein  32.16 
 
 
266 aa  149  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2098  S-ribosylhomocysteine lyase (autoinducer-2 productionprotein LuxS; AI-2 synthesis protein)  32.58 
 
 
290 aa  148  9e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.19682  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1608  hypothetical protein  33.46 
 
 
266 aa  146  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.384595 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  31.25 
 
 
267 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3010  protein of unknown function DUF191  32.18 
 
 
263 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0202  hypothetical protein  32.45 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0340  hypothetical protein  31.06 
 
 
288 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0533  hypothetical protein  28.68 
 
 
256 aa  133  3e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0620  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha (succinyl-CoA synthetase subunit alpha) (SCS-alpha)  30.94 
 
 
290 aa  133  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2237  protein of unknown function DUF191  31.32 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2413  protein of unknown function DUF191  33.61 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113534 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2004  hypothetical protein  32.17 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0715126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1670  hypothetical protein  30.97 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1846  hypothetical protein  30.97 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2048  hypothetical protein  29.85 
 
 
286 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.343897  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0154  conserved hypothetical protein (DUF191 domain protein)  28.3 
 
 
287 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0049  protein of unknown function DUF191  20 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  22.89 
 
 
283 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0779  periplasmic solute-binding protein-like protein  19.56 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  23.91 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  27.69 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  23.91 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  24.32 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  23.81 
 
 
284 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>