59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2004 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2004  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  589  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0715126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0620  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha (succinyl-CoA synthetase subunit alpha) (SCS-alpha)  66.67 
 
 
290 aa  392  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2237  protein of unknown function DUF191  64.93 
 
 
288 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2098  S-ribosylhomocysteine lyase (autoinducer-2 productionprotein LuxS; AI-2 synthesis protein)  62.02 
 
 
290 aa  378  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.19682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0202  hypothetical protein  62.5 
 
 
288 aa  375  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0340  hypothetical protein  62.37 
 
 
288 aa  373  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0154  conserved hypothetical protein (DUF191 domain protein)  63.64 
 
 
287 aa  355  2.9999999999999997e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1846  hypothetical protein  59.58 
 
 
286 aa  347  2e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1670  hypothetical protein  59.23 
 
 
286 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2048  hypothetical protein  58.89 
 
 
286 aa  345  6e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.343897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  35.69 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  35.88 
 
 
275 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  35.87 
 
 
271 aa  152  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  31.78 
 
 
261 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  32.36 
 
 
284 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  34.55 
 
 
267 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0686  hypothetical protein  33.72 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1702  protein of unknown function DUF191  34.57 
 
 
276 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2176  hypothetical protein  33.83 
 
 
276 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1773  protein of unknown function DUF191  33.83 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  31.84 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  32.84 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  32.22 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1615  hypothetical protein  29.78 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0830  hypothetical protein  30.63 
 
 
266 aa  123  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  28.9 
 
 
282 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  31.94 
 
 
267 aa  123  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  30.42 
 
 
281 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  30.16 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  31.27 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0462  hypothetical protein  31.64 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.104402  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  28.52 
 
 
275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  29.78 
 
 
278 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  31.18 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0599  protein of unknown function DUF191  31.25 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000197308  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1608  hypothetical protein  31.44 
 
 
266 aa  112  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.384595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  28.35 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  30.07 
 
 
264 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  28.16 
 
 
304 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4152  protein of unknown function DUF191  26.76 
 
 
281 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_002620  TC0533  hypothetical protein  27.84 
 
 
256 aa  105  7e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0552  hypothetical protein  26.44 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00285947  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1815  hypothetical protein  27.69 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0151  hypothetical protein  30.94 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0137772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  27.56 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  29.12 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2413  protein of unknown function DUF191  31.97 
 
 
286 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4422  hypothetical protein  29.18 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928924  normal  0.490091 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1278  protein of unknown function DUF191  28.74 
 
 
285 aa  92  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3010  protein of unknown function DUF191  28.52 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3946  hypothetical protein  25.77 
 
 
320 aa  89  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4337  hypothetical protein  26.04 
 
 
298 aa  89  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  27.45 
 
 
280 aa  89  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0260  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3234  hypothetical protein  28.67 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4199  protein of unknown function DUF191  29.35 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0779  periplasmic solute-binding protein-like protein  24.36 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.124322 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0049  protein of unknown function DUF191  26.54 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8091  protein of unknown function DUF191  25.93 
 
 
272 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>