59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0599 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0599  protein of unknown function DUF191  100 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000197308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  96.88 
 
 
288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0686  hypothetical protein  69.43 
 
 
277 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  68.01 
 
 
281 aa  361  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  68.42 
 
 
278 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  64.47 
 
 
277 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  63.6 
 
 
284 aa  340  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  57.14 
 
 
272 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  54.35 
 
 
297 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  52.22 
 
 
278 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  53.53 
 
 
280 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  55.47 
 
 
276 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0552  hypothetical protein  53.01 
 
 
307 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00285947  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  52.71 
 
 
279 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  51.69 
 
 
282 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1815  hypothetical protein  53.49 
 
 
279 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  48.63 
 
 
261 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2176  hypothetical protein  53.73 
 
 
276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1615  hypothetical protein  53.52 
 
 
287 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1773  protein of unknown function DUF191  53.73 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1702  protein of unknown function DUF191  53.73 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  48.87 
 
 
264 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4152  protein of unknown function DUF191  44.04 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4337  hypothetical protein  46.53 
 
 
298 aa  228  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3946  hypothetical protein  46.53 
 
 
320 aa  228  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3234  hypothetical protein  45.26 
 
 
282 aa  228  8e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0260  hypothetical protein  44.89 
 
 
282 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4422  hypothetical protein  48.9 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928924  normal  0.490091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4199  protein of unknown function DUF191  46.35 
 
 
282 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0151  hypothetical protein  50.37 
 
 
293 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0137772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  45.09 
 
 
304 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8091  protein of unknown function DUF191  47.89 
 
 
272 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1278  protein of unknown function DUF191  47.08 
 
 
285 aa  215  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  39.41 
 
 
280 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  39.64 
 
 
275 aa  207  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0830  hypothetical protein  41.73 
 
 
266 aa  205  6e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  42.16 
 
 
267 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0462  hypothetical protein  41.13 
 
 
268 aa  199  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.104402  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  40.75 
 
 
267 aa  195  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  37.78 
 
 
291 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  40.59 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  36.7 
 
 
280 aa  181  9.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1608  hypothetical protein  35.96 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.384595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  34.21 
 
 
275 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2413  protein of unknown function DUF191  36.69 
 
 
286 aa  148  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3010  protein of unknown function DUF191  36.92 
 
 
263 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2237  protein of unknown function DUF191  32.51 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0533  hypothetical protein  29.8 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0340  hypothetical protein  30.61 
 
 
288 aa  105  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0154  conserved hypothetical protein (DUF191 domain protein)  31.3 
 
 
287 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2098  S-ribosylhomocysteine lyase (autoinducer-2 productionprotein LuxS; AI-2 synthesis protein)  32.16 
 
 
290 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.19682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0202  hypothetical protein  30.89 
 
 
288 aa  103  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1670  hypothetical protein  29.57 
 
 
286 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1846  hypothetical protein  29.18 
 
 
286 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2004  hypothetical protein  31.25 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0715126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2048  hypothetical protein  29.18 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.343897  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0620  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha (succinyl-CoA synthetase subunit alpha) (SCS-alpha)  29.48 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0049  protein of unknown function DUF191  21.9 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0779  periplasmic solute-binding protein-like protein  24.29 
 
 
288 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.124322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>