57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0260 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0260  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3234  hypothetical protein  77.7 
 
 
282 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4199  protein of unknown function DUF191  73.31 
 
 
282 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3946  hypothetical protein  59.79 
 
 
320 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4337  hypothetical protein  59.45 
 
 
298 aa  329  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  61.9 
 
 
304 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  62.13 
 
 
264 aa  328  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4422  hypothetical protein  60.22 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928924  normal  0.490091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0151  hypothetical protein  58.61 
 
 
293 aa  299  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0137772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8091  protein of unknown function DUF191  59.02 
 
 
272 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0686  hypothetical protein  47.06 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  49.46 
 
 
281 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  44.96 
 
 
284 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  47.08 
 
 
280 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  45.65 
 
 
277 aa  228  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0599  protein of unknown function DUF191  44.89 
 
 
288 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000197308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  44.4 
 
 
288 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  45.45 
 
 
278 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  47.58 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  45.45 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0552  hypothetical protein  46.21 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00285947  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  44.17 
 
 
282 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  44.65 
 
 
278 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  43.64 
 
 
279 aa  203  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1278  protein of unknown function DUF191  46.97 
 
 
285 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1615  hypothetical protein  45.26 
 
 
287 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1815  hypothetical protein  44.98 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2176  hypothetical protein  45.04 
 
 
276 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1773  protein of unknown function DUF191  44.96 
 
 
276 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1702  protein of unknown function DUF191  44.72 
 
 
276 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  42.45 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  40.98 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4152  protein of unknown function DUF191  36.53 
 
 
281 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  38.49 
 
 
271 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  35.48 
 
 
275 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  34.42 
 
 
291 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  33.8 
 
 
280 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  35.59 
 
 
280 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  37.23 
 
 
267 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2413  protein of unknown function DUF191  39.63 
 
 
286 aa  155  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3010  protein of unknown function DUF191  37.83 
 
 
263 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  36.2 
 
 
267 aa  149  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0462  hypothetical protein  36.17 
 
 
268 aa  149  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.104402  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0830  hypothetical protein  36.33 
 
 
266 aa  145  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1608  hypothetical protein  35.53 
 
 
266 aa  142  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.384595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  30.04 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_002620  TC0533  hypothetical protein  34.44 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0154  conserved hypothetical protein (DUF191 domain protein)  28.83 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2048  hypothetical protein  32.84 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.343897  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1670  hypothetical protein  30.74 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2237  protein of unknown function DUF191  28.37 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0340  hypothetical protein  27.8 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1846  hypothetical protein  30.37 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0620  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha (succinyl-CoA synthetase subunit alpha) (SCS-alpha)  29.5 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2098  S-ribosylhomocysteine lyase (autoinducer-2 productionprotein LuxS; AI-2 synthesis protein)  26.88 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.19682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0202  hypothetical protein  25.9 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2004  hypothetical protein  27.5 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0715126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>