43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6842 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 577 aa  1215    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  52.98 
 
 		 576 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  51.36 
 
 		 570 aa  602  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  47.81 
 
 		 575 aa  595  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.13 
 
 		 580 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  34.65 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.27 
 
 		 612 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.63 
 
 		 627 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.55 
 
 		 619 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  30.84 
 
 		 615 aa  250  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.38 
 
 		 684 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.38 
 
 		 683 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.38 
 
 		 683 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.18 
 
 		 658 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.21 
 
 		 665 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  30.39 
 
 		 627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.2 
 
 		 683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.95 
 
 		 631 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.86 
 
 		 659 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.98 
 
 		 663 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.43 
 
 		 613 aa  238  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  29.6 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  28.7 
 
 		 592 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.2 
 
 		 634 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.7 
 
 		 581 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.62 
 
 		 609 aa  200  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.67 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  26.97 
 
 		 634 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.68 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.74 
 
 		 580 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.63 
 
 		 526 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.54 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  22.15 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.04 
 
 		 606 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.86 
 
 		 862 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.52 
 
 		 506 aa  50.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  19.83 
 
 		 606 aa  50.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  27.56 
 
 		 840 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  21.15 
 
 		 823 aa  48.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.14 
 
 		 599 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.68 
 
 		 618 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  24.38 
 
 		 885 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.25 
 
 		 874 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>