42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3225 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3225  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1199    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1015  hypothetical protein  30.27 
 
 		 541 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 403 aa  54.7  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  28.87 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  28.87 
 
 		 466 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  32.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0178  GUN4-like  28.42 
 
 		 559 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000497221  normal  0.66578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  28.72 
 
 		 855 aa  50.4  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 		 355 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  30.67 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  29.8 
 
 		 497 aa  49.7  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2023  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 537 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  29.61 
 
 		 460 aa  48.1  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.17 
 
 		 845 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  28.86 
 
 		 501 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2618  GUN4-like  23.35 
 
 		 623 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.85 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2107  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 		 394 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0027077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  27.74 
 
 		 527 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  28.19 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1644  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.45 
 
 		 267 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3571  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.02 
 
 		 701 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.226926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  29.53 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1229  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.49 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0581563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  27.27 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.46 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  32.45 
 
 		 528 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  29.21 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  30.06 
 
 		 511 aa  45.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  30.56 
 
 		 451 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  34.51 
 
 		 323 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  32.58 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  30.56 
 
 		 451 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0929  protease Do  32.46 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  30.06 
 
 		 511 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  30.67 
 
 		 498 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.39 
 
 		 820 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  29.19 
 
 		 497 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  28.86 
 
 		 511 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.11 
 
 		 487 aa  44.3  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  28.5 
 
 		 502 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  28.43 
 
 		 505 aa  43.9  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>