More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2371 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2371  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
395 aa  822    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0291756  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6299  glycosyl transferase group 1  56.49 
 
 
385 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3258  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  36.33 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  38.2 
 
 
370 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
395 aa  116  6e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
382 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  37.44 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  29.63 
 
 
336 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
374 aa  106  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  29.33 
 
 
374 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.15 
 
 
351 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
373 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
394 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1739 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
398 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
364 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
378 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
442 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
442 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
364 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
373 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.92 
 
 
364 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  33.67 
 
 
370 aa  97.4  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  31.09 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.71 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
374 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  28.98 
 
 
381 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
367 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
428 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.3 
 
 
353 aa  92.8  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
435 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
387 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
387 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  28.47 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
444 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.06 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  31.9 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
389 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
354 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
400 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  31.9 
 
 
381 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
384 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.07 
 
 
369 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.5 
 
 
364 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
464 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  37.04 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
375 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  30.74 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
377 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
431 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
386 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
1089 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
357 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
381 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
417 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
355 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
393 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
360 aa  86.3  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
1770 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  27.9 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.54 
 
 
2490 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
1241 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
672 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>