219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1860 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
149 aa  309  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  58.27 
 
 
138 aa  178  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 
149 aa  152  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  52.63 
 
 
149 aa  152  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  45.19 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  48.09 
 
 
157 aa  137  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  39.23 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  33.59 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  33.85 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
134 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  35.71 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  31.3 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  34.71 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.94 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.79 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  30.82 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.05 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.77 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  30.15 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.2 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.84 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  36.13 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.13 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  26.36 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  30.89 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  28.78 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  24.11 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  28.78 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.39 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.43 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  28.57 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  28.19 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1860  hypothetical protein  30.53 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  26.32 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  27.68 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.03 
 
 
161 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
165 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.21 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.28 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>