More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3311 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  64.49 
 
 		 215 aa  275  6e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  51.01 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  48.74 
 
 		 209 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  47.98 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  45.96 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  45.45 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  46.7 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  44.56 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  40 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  47.21 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  44.16 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  46.7 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  43.08 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  39.59 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  40.4 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  41.2 
 
 		 978 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  40.53 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  40.2 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  40.11 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  40.62 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  42.33 
 
 		 965 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  40.53 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  40 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  40 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  40 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  40 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  37.04 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  42.86 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  41.15 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  38.07 
 
 		 986 aa  138  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  39.47 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  37.17 
 
 		 585 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  37.31 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  37.63 
 
 		 223 aa  131  7.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  41.29 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  38.5 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.24 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 456 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  34.78 
 
 		 456 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  35.75 
 
 		 456 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.25 
 
 		 1055 aa  99.4  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32 
 
 		 1051 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  34.63 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 		 268 aa  95.9  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.46 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.68 
 
 		 218 aa  94.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.29 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.13 
 
 		 1051 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  32.98 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 1052 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  32.45 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.05 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  30.53 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.67 
 
 		 1053 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.88 
 
 		 1053 aa  89  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.19 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  31.41 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  34.21 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.11 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.69 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.07 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.93 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  30.46 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.79 
 
 		 396 aa  85.9  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.09 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  32.82 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.84 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.84 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.77 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  31.84 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  39.5 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  26.4 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.21 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.21 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.57 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  29.95 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.84 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.22 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.02 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.06 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.19 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1995  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.49 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>