More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2302 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  100 
 
 		 395 aa  810    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  47.47 
 
 		 383 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  44.53 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  44.53 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  42.64 
 
 		 387 aa  322  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  42.35 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  42.2 
 
 		 380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  43.23 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1547  aminotransferase class V  44.05 
 
 		 382 aa  315  9e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  41.71 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  42.42 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  42.46 
 
 		 380 aa  302  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  42.46 
 
 		 380 aa  302  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  40.92 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 380 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  40.92 
 
 		 380 aa  299  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 380 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  40.41 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  40.41 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  44.64 
 
 		 384 aa  295  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  39.64 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.12 
 
 		 392 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.75 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.41 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  42.64 
 
 		 404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.62 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.36 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.49 
 
 		 400 aa  279  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.04 
 
 		 384 aa  276  7e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  40.71 
 
 		 493 aa  275  8e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.33 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.33 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 404 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  40.1 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  42.05 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  37.34 
 
 		 382 aa  270  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  38.82 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0713  Cysteine desulfurase  38.92 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  39.39 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  38.76 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.51 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.24 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 381 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  40.82 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  40 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  38.82 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  40.05 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  37.44 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  39.03 
 
 		 406 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  40.82 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.28 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  39.59 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  39.8 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  39.34 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  40.61 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  38.62 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  39.03 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  39.34 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  39.34 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  39.34 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  39.19 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  38.05 
 
 		 384 aa  265  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.07 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  39.8 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  39.8 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  37.95 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  40.26 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  41.33 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  39.74 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.78 
 
 		 381 aa  262  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40 
 
 		 414 aa  262  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>