119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1866 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1866  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  824    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.908975  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2155  hypothetical protein  35.75 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1055  hypothetical protein  28.27 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0997  hypothetical protein  29.06 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.728779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1058  protein of unknown function DUF1006  28.41 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  28.39 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2834  hypothetical protein  27.79 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  27.32 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  25.13 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  25.64 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  24.56 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  27.22 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  24.17 
 
 		 409 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  24.17 
 
 		 416 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  24.17 
 
 		 409 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  24.42 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  24.42 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  24.42 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  26.27 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  25.06 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  26.8 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  26.1 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  26.1 
 
 		 410 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  26.55 
 
 		 410 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  26.29 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  25.13 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  30.49 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  23.64 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  23.64 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  23.64 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  24.94 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  24.75 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  23.64 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  23.64 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  23.64 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  24.81 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  30.18 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  23.85 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  27.62 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0040  hypothetical protein  24.37 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  23.62 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  26.29 
 
 		 389 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  25 
 
 		 411 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  23.58 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  29.27 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  29.61 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  28.99 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  26.32 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  26.2 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  23.12 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  23.25 
 
 		 398 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  25.48 
 
 		 409 aa  113  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  28.34 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  23.74 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  23.51 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  24.1 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  26.04 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1381  hypothetical protein  23.53 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3685  hypothetical protein  24.23 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  25.08 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0049  hypothetical protein  23.53 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  23.38 
 
 		 397 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  25.07 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  25.56 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  27.56 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  24.49 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  24.49 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  24.62 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  24.14 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  24.49 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  26.18 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  24.43 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  26.04 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  26.2 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  24.09 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  27.65 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  24.22 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  23.2 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  25.23 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  23.79 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  22.94 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  23.63 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  26.27 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  25.06 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  22.22 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  31.48 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  26.45 
 
 		 442 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3506  protein of unknown function DUF1006  23.27 
 
 		 359 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  0.204168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  25.29 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  25.58 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  23.16 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  23.76 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  28.64 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4021  hypothetical protein  24.52 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  25.7 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2209  hypothetical protein  21.45 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266016  normal  0.263696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2127  hypothetical protein  23.79 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3809  protein of unknown function DUF1006  23.62 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0215  protein of unknown function DUF1006  24 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>