53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1704 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1686  hypothetical protein  90.78 
 
 		 359 aa  658    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0479604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1703  hypothetical protein  83.94 
 
 		 357 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2811  hypothetical protein  48.03 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0259  putative 3-carboxymuconate cyclase  36.04 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4891  hypothetical protein  28.82 
 
 		 434 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6277  hypothetical protein  31.02 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5379  putative 3-carboxymuconate cyclase  29.91 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  26.07 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  26.07 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  26.07 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  26.07 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  26.07 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  24 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  26.25 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  26.18 
 
 		 331 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  26.18 
 
 		 331 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  26.18 
 
 		 331 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  26.18 
 
 		 331 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  26.18 
 
 		 331 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  24.46 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  26.18 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  25.08 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  26.55 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  26.18 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.37 
 
 		 521 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  24.38 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  36.17 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.05 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  24.83 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  24.52 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  27.1 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  24.51 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  24.52 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  24.52 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  24.83 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  24.49 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  23.83 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  24.5 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  24.5 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  23.91 
 
 		 376 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  23.84 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  23.91 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  25.37 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  25.16 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  26.17 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  22.43 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  24.02 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  24.02 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  34.02 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  24.39 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  24.79 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  22.34 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>