More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1544 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1544  helicase c2  100 
 
 		 635 aa  1312    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0592026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1991  helicase c2  57.5 
 
 		 657 aa  766    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0246396  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  37.03 
 
 		 646 aa  412  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2382  helicase c2  37.1 
 
 		 653 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1300  helicase c2  35.08 
 
 		 645 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1692  hypothetical protein  34.92 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1442  ATP-dependent helicase DinG  34.76 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1443  ATP-dependent helicase DinG  34.76 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1619  hypothetical protein  34.92 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1731  hypothetical protein  34.92 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000833443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3725  hypothetical protein  34.76 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0167806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1656  hypothetical protein  34.76 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.10694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1486  helicase c2  35.08 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.530371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1470  hypothetical protein  34.6 
 
 		 645 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1586  hypothetical protein  34.6 
 
 		 645 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.7 
 
 		 652 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  29.83 
 
 		 658 aa  229  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  29.37 
 
 		 652 aa  226  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  29.76 
 
 		 729 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  28.57 
 
 		 636 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  28.68 
 
 		 653 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  28.77 
 
 		 646 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  29.4 
 
 		 633 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  28.16 
 
 		 668 aa  211  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  27.36 
 
 		 636 aa  211  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  27.4 
 
 		 713 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  28.17 
 
 		 725 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  29.5 
 
 		 631 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  28.33 
 
 		 725 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  29.26 
 
 		 633 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  28.57 
 
 		 635 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  27.67 
 
 		 643 aa  206  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  28.01 
 
 		 640 aa  205  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  29.03 
 
 		 659 aa  204  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  26.6 
 
 		 743 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.39 
 
 		 832 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  27.8 
 
 		 646 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.72 
 
 		 960 aa  200  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  27.86 
 
 		 641 aa  199  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  27.86 
 
 		 641 aa  199  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  27.8 
 
 		 644 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  24.89 
 
 		 822 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  27.07 
 
 		 754 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  27.41 
 
 		 646 aa  196  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  27.59 
 
 		 641 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  28.17 
 
 		 660 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  27.52 
 
 		 843 aa  194  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.63 
 
 		 641 aa  193  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  193  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  27.3 
 
 		 661 aa  193  9e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  27.4 
 
 		 851 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.56 
 
 		 934 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  28.2 
 
 		 646 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.71 
 
 		 934 aa  191  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  25.47 
 
 		 636 aa  190  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.61 
 
 		 934 aa  190  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  27.85 
 
 		 640 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.99 
 
 		 956 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.69 
 
 		 929 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  25.86 
 
 		 636 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  189  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  189  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  25.86 
 
 		 636 aa  189  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  25.86 
 
 		 636 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.56 
 
 		 934 aa  188  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  26.57 
 
 		 651 aa  187  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  28.11 
 
 		 675 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  25.55 
 
 		 639 aa  187  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.6 
 
 		 934 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  26.01 
 
 		 636 aa  187  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.51 
 
 		 934 aa  187  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.51 
 
 		 934 aa  187  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  26.62 
 
 		 830 aa  187  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  27.38 
 
 		 640 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.06 
 
 		 957 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  28.24 
 
 		 669 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  25.79 
 
 		 647 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.58 
 
 		 934 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.58 
 
 		 934 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  26.19 
 
 		 645 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  27.94 
 
 		 674 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.58 
 
 		 934 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  28.09 
 
 		 669 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  28.08 
 
 		 929 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  25.8 
 
 		 639 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  25.7 
 
 		 636 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  27.1 
 
 		 664 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  26.61 
 
 		 751 aa  185  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  25.63 
 
 		 634 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  26.77 
 
 		 755 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.79 
 
 		 944 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.41 
 
 		 952 aa  183  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  28.09 
 
 		 640 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.69 
 
 		 930 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>