More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0971 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  53.26 
 
 		 276 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  38.05 
 
 		 302 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  44.66 
 
 		 291 aa  93.6  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 299 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 299 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 299 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 299 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1997  DNA-binding transcriptional activator MarA  37.07 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 299 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1651  DNA-binding transcriptional activator MarA  36.21 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00571718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 299 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1816  DNA-binding transcriptional activator MarA  36.21 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1624  DNA-binding transcriptional activator MarA  36.21 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.936948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  43.88 
 
 		 306 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1632  DNA-binding transcriptional activator MarA  36.21 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1691  DNA-binding transcriptional activator MarA  36.21 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01490  DNA-binding transcriptional dual activator of multiple antibiotic resistance  37.14 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2115  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2127  DNA-binding transcriptional activator MarA  37.14 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.299134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01501  hypothetical protein  37.14 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2145  DNA-binding transcriptional activator MarA  37.14 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1733  DNA-binding transcriptional activator MarA  37.14 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1674  DNA-binding transcriptional activator MarA  37.14 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1639  DNA-binding transcriptional activator MarA  37.14 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 299 aa  90.5  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  40.95 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  37.01 
 
 		 279 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  40.95 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  46 
 
 		 295 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  46 
 
 		 293 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  45.92 
 
 		 295 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  45.92 
 
 		 288 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  40 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  40 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 303 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  40 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 296 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  41.96 
 
 		 288 aa  86.7  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  41.96 
 
 		 288 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 288 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 289 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 289 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  45.26 
 
 		 289 aa  84.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 279 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  42.86 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  42.86 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  42.86 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  42.86 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  42.86 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 307 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03934  DNA-binding transcriptional dual regulator  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0326041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3930  transcriptional regulator, AraC family  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3965  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5565  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4615  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4580  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03894  hypothetical protein  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0334168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4304  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  44.57 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 293 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 300 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 300 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 		 300 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 300 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 279 aa  80.5  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 276 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 293 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 300 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>