59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0400 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
180 aa  359  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  45.86 
 
 
179 aa  155  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  42.67 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  40.27 
 
 
173 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  104  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  37.33 
 
 
173 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  38.85 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  32.48 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  30.63 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  29.11 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  34.91 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  31.88 
 
 
222 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  30.65 
 
 
220 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  32.61 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  29 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  29.46 
 
 
203 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  33.65 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  26.38 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  27.96 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  31.25 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  26.67 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  29.21 
 
 
154 aa  47.8  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  25.74 
 
 
160 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  34.21 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  25 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  28.57 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  26.79 
 
 
151 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0595  hypothetical protein  28.71 
 
 
166 aa  44.7  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  23.68 
 
 
153 aa  44.7  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  32.58 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  27.47 
 
 
161 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  25.88 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  29.41 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  22.58 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  26.32 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  25.81 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  26.32 
 
 
201 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  26.67 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  27.27 
 
 
159 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  26.14 
 
 
151 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  26.14 
 
 
161 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  27.66 
 
 
204 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  27.66 
 
 
204 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  25.56 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  21.21 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  21.21 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  22.46 
 
 
147 aa  41.2  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  21.21 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  24.18 
 
 
153 aa  41.2  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  26.88 
 
 
205 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  23.08 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2078  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  41.2  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.353581  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  25.27 
 
 
153 aa  40.8  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  27.5 
 
 
170 aa  40.8  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  29.58 
 
 
263 aa  40.8  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>