58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2038 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2038  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  858    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0333853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0393  hypothetical protein  62.44 
 
 		 418 aa  549  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2392  hypothetical protein  60.05 
 
 		 416 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0299  hypothetical protein  61.27 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2049  hypothetical protein  53.4 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0404776  normal  0.28039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1851  hypothetical protein  51.8 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0355  hypothetical protein  51.36 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.864294  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2374  hypothetical protein  34.93 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3271  sugar phosphate nucleotydyl transferase  35.99 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6090  hypothetical protein  33.58 
 
 		 398 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10013  hypothetical protein  32.58 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0410796  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0635  hypothetical protein  30.18 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1567  hypothetical protein  32.84 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.405342  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0108  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase/translation initiation factor 2B gamma/epsilon subunits-like protein  30.41 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.587569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2649  hypothetical protein  31.53 
 
 		 457 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2717  hypothetical protein  32.19 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0490  hexapeptide repeat-containing protein  33.09 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2392  hypothetical protein  30.95 
 
 		 413 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.385122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0653  hypothetical protein  30.19 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.379776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6210  hypothetical protein  27.37 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.32 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1564  sugar phospate transferase  30 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000011841 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1692  sugar phospate transferase  32.84 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000413116 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0619  sugar phospate transferase  29.77 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.496353  hitchhiker  0.0000000866776 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1548  sugar phospate transferase  27.27 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.492099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  30.54 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1502  sugar phospate transferase  28.57 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  30.11 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  26.5 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  27.65 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.27 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  27.31 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.73 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  27.9 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  26.77 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  26.98 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  28.36 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  27.46 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  26.34 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  26.47 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  27.01 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  29.14 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.93 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  30.57 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  26.03 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3271  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  29.01 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000643318  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  28.25 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  26.67 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0918  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase GlmU-related enzyme  22.28 
 
 		 218 aa  53.5  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  24.84 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  24.68 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  27.34 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  24.85 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6661  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.71 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51490  LpxA family transferase  28.15 
 
 		 209 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.24 
 
 		 269 aa  43.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.190345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>