More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1864 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1864  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
362 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1101  gamma-glutamyl kinase  76.62 
 
 
362 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1683  gamma-glutamyl kinase  76.27 
 
 
359 aa  554  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0321844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1096  gamma-glutamyl kinase  73.52 
 
 
362 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0894  gamma-glutamyl kinase  68.82 
 
 
361 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1575  gamma-glutamyl kinase  69.1 
 
 
363 aa  501  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730383 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1477  gamma-glutamyl kinase  65.28 
 
 
368 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1414  gamma-glutamyl kinase  41.74 
 
 
356 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1575  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  36.81 
 
 
373 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  35.31 
 
 
376 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  37.46 
 
 
372 aa  222  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  36.83 
 
 
373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  35.21 
 
 
373 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  37.97 
 
 
373 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  34.06 
 
 
374 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  34.33 
 
 
390 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  36.11 
 
 
378 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  36.19 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  36.63 
 
 
373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  35.28 
 
 
379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  35.29 
 
 
373 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  34.7 
 
 
372 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  34.5 
 
 
375 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 
372 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 
372 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 
372 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 
372 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  35.13 
 
 
393 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  34.45 
 
 
367 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  34.45 
 
 
367 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  34.45 
 
 
367 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  34.45 
 
 
367 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  34.45 
 
 
367 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  35.24 
 
 
373 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  34.46 
 
 
373 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  35.08 
 
 
372 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  35.62 
 
 
372 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  34.56 
 
 
367 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  31.79 
 
 
374 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  34.53 
 
 
372 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  32.51 
 
 
372 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  34.69 
 
 
378 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  32.97 
 
 
371 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  34.21 
 
 
395 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  33.33 
 
 
376 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  36.11 
 
 
366 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  35.19 
 
 
376 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 
372 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
375 aa  202  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  33.72 
 
 
384 aa  202  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  34.17 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  34.45 
 
 
367 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  33.71 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  33.51 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  34.08 
 
 
367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  33.9 
 
 
390 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  36.44 
 
 
370 aa  199  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  33.7 
 
 
378 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  35.6 
 
 
372 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  33.51 
 
 
378 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 
372 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 
372 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  34.8 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  32.18 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  33.42 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  35.07 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  33.95 
 
 
371 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  34.15 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  33.82 
 
 
385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4153  glutamate 5-kinase  35.5 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279034  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  33.06 
 
 
372 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  34.59 
 
 
379 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  33.53 
 
 
379 aa  195  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  32.51 
 
 
372 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 
372 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 
372 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  32.97 
 
 
372 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  32.24 
 
 
372 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  30.71 
 
 
376 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  32.7 
 
 
393 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  33.6 
 
 
378 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  34.32 
 
 
376 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  34.75 
 
 
387 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  31.98 
 
 
390 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  34.18 
 
 
373 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  33.33 
 
 
383 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  31.34 
 
 
372 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 
372 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 
372 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  32.79 
 
 
372 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>