More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1993 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
278 aa  577  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  58.82 
 
 
293 aa  334  9e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  57.25 
 
 
276 aa  310  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  49.48 
 
 
311 aa  278  5e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.16 
 
 
278 aa  258  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  45.32 
 
 
276 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.68 
 
 
312 aa  232  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.06 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.83 
 
 
285 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  37.79 
 
 
285 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 
293 aa  148  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  142  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.56 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 
287 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.47 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.21 
 
 
286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.3 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.65 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.67 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.6 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.45 
 
 
313 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.13 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.34 
 
 
312 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.34 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.34 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.34 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 
312 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 
312 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 
312 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 
312 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 
312 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.8 
 
 
309 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.53 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  31.86 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.34 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.65 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.55 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.91 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.67 
 
 
300 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.74 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.55 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.55 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1969  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.6 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0196  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.04 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.886747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  31.58 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.23 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1260  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.24 
 
 
278 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.337848  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  30.81 
 
 
299 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.18 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.78 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.1 
 
 
312 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2077  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.43 
 
 
308 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.27 
 
 
298 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
295 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.17 
 
 
277 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.3 
 
 
321 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.23 
 
 
297 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.43 
 
 
293 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.62 
 
 
312 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.7 
 
 
300 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0954  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.78 
 
 
299 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.18 
 
 
298 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 
300 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0089  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.63 
 
 
317 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.68 
 
 
295 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.44 
 
 
300 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  33 
 
 
300 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.39 
 
 
315 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0023  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  34.76 
 
 
287 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1185  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.06 
 
 
324 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.89 
 
 
300 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.89 
 
 
300 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.73 
 
 
295 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.97 
 
 
296 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  32.6 
 
 
258 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.82 
 
 
293 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2455  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 
302 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737706  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.46 
 
 
300 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5570  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 
294 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  31.58 
 
 
296 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.7 
 
 
295 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.88 
 
 
294 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1586  ribosomal L11 methyltransferase  29.07 
 
 
275 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.472869  normal  0.567959 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  26.95 
 
 
282 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  31.58 
 
 
264 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.51 
 
 
300 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.63 
 
 
304 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.71 
 
 
307 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174777  unclonable  0.000000000413669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.77 
 
 
313 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64140  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.29 
 
 
294 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258424  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 
287 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 
287 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3442  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.27 
 
 
293 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.33 
 
 
293 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.33 
 
 
293 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.33 
 
 
306 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.42 
 
 
292 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.49 
 
 
293 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>