More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1593 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1593  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.516871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1333  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.28 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.206464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  49.29 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.553132 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.24 
 
 		 392 aa  209  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1605  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.18 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.119603  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0202  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.21 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.630911 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0185  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.86 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.374978  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1238  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.77 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0675  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.81 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  32.5 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  35.96 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  33.95 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  31.51 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  33.78 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  34.15 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  30.1 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  33.2 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  31.89 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  31.94 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  33.11 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  33.33 
 
 		 372 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  30.82 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  34.32 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  31.07 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  32.66 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  31.25 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  34.43 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  30.33 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  31.62 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  31.62 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  31.62 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  35.79 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  31.48 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  31.77 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  30.9 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  33.22 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  29.39 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  29.83 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  30.14 
 
 		 764 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  29.83 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  31.97 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  30.54 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  29.51 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  33.81 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  30.69 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  31.58 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  27.83 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  34.24 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  28.16 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  30.58 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  28.09 
 
 		 316 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  30.39 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  31.6 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  33.78 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  30.92 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  29.08 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  27.12 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  30 
 
 		 461 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  27.67 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  27.27 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  32.2 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  30.47 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  29.49 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  32.8 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  32.64 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  33.11 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  32.82 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  31.46 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  31.46 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  31.46 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  30.32 
 
 		 320 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  30.71 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  29.11 
 
 		 315 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  31.46 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  31.46 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  31.46 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  31.46 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  31.46 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  30.88 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  32.18 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  32.1 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  29.6 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  31.46 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.3 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  30.55 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  29.96 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  32.45 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  32.03 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  30.88 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  30.88 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  27.99 
 
 		 771 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  35.05 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  31.56 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  31.02 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  30.29 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  29.05 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  34.16 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  31.86 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  32.25 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  31.44 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>