80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1512 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1512  AAA ATPase  100 
 
 
595 aa  1216    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000264338  normal  0.723812 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1145  AAA ATPase  44.67 
 
 
533 aa  484  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00264126  hitchhiker  0.0000264348 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1296  AAA ATPase  42.44 
 
 
537 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0819436 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1108  AAA ATPase  44.25 
 
 
534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00107728  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1098  hypothetical protein  27.47 
 
 
521 aa  168  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0102  HerA-ATP synthase, barrel domain protein  29.01 
 
 
609 aa  140  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2082  AAA ATPase  25.85 
 
 
600 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.901274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1979  Tubulin  22.55 
 
 
625 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0773401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  29.21 
 
 
651 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  21.7 
 
 
524 aa  53.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2277  hypothetical protein  23.96 
 
 
653 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  25.39 
 
 
499 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  26.54 
 
 
508 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  26.75 
 
 
605 aa  51.2  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  30 
 
 
501 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  41.27 
 
 
511 aa  50.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  30.97 
 
 
531 aa  50.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  29.94 
 
 
783 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  24.87 
 
 
499 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  23.83 
 
 
570 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0732  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.1 
 
 
488 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0114727  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  32.04 
 
 
524 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0767  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  29.41 
 
 
482 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2231  hypothetical protein  28.48 
 
 
521 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0965874  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  33.33 
 
 
606 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3749  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.44 
 
 
500 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0662864  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0236  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.22 
 
 
496 aa  48.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1223  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.81 
 
 
514 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00822087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4351  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  36.84 
 
 
491 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.012441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  26.57 
 
 
581 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1372  hypothetical protein  36.84 
 
 
491 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4442  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  36.84 
 
 
491 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.905304  hitchhiker  0.0000193157 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.75 
 
 
523 aa  47.4  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4789  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  28.39 
 
 
514 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  27.57 
 
 
643 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3654  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.22 
 
 
500 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2022  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.33 
 
 
557 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1897  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  29.8 
 
 
503 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0908491  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.28 
 
 
529 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3204  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  29.73 
 
 
507 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5785  hypothetical protein  26.83 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00669177  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04093  hypothetical protein  26.83 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437855  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  28.68 
 
 
608 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1702  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  29.73 
 
 
502 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04129  predicted ATPase  26.83 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.431713  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  28.68 
 
 
608 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4068  hypothetical protein  27.81 
 
 
541 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4744  hypothetical protein  26.83 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0318785  normal  0.98435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3734  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.83 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.600698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1012  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  35.53 
 
 
491 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000194694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  32.48 
 
 
513 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0444  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.49 
 
 
524 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0693836  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1312  hypothetical protein  29.53 
 
 
515 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4519  hypothetical protein  26.83 
 
 
500 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000859541  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4817  hypothetical protein  26.83 
 
 
500 aa  45.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00312271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3852  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  29.14 
 
 
505 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  33.82 
 
 
516 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  27.83 
 
 
591 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3542  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  26.49 
 
 
543 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416289  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  27.59 
 
 
559 aa  44.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3529  hypothetical protein  27.45 
 
 
536 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  30.21 
 
 
569 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  29.13 
 
 
492 aa  44.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0459  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  35.48 
 
 
497 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4430  hypothetical protein  35.53 
 
 
495 aa  44.3  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0089  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  29.59 
 
 
491 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4836  hypothetical protein  26.22 
 
 
500 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000653742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0786  hypothetical protein  26.9 
 
 
511 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0655509  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4415  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.45 
 
 
521 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.763813  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2524  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.1 
 
 
478 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4878  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.45 
 
 
521 aa  44.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1966  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.58 
 
 
505 aa  44.3  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  24.38 
 
 
563 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2668  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  29.8 
 
 
504 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.881432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.58 
 
 
521 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  22.89 
 
 
496 aa  43.9  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55980  hypothetical protein  35.53 
 
 
496 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0734375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4875  hypothetical protein  35.53 
 
 
496 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3308  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  34.21 
 
 
494 aa  43.9  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0578  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  28.65 
 
 
520 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215105  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>