67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1396 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  54.03 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  54.03 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  52.77 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  49.6 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  52.17 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  47.03 
 
 		 239 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  45.58 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  40.89 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  39.83 
 
 		 253 aa  184  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.82 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  25.25 
 
 		 333 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  34.94 
 
 		 310 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  24.53 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.7 
 
 		 336 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  22.68 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  31.08 
 
 		 448 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  23.2 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.19 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  33.85 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  22.28 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  23.27 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 285 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 407 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.12 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  22.73 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  21.32 
 
 		 359 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  21.76 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  21.76 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  21.76 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.68 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  23.28 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  22.96 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  24.6 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 355 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  25.26 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  25.32 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  25.26 
 
 		 348 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  23.81 
 
 		 367 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 283 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  23.6 
 
 		 356 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 356 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  23.81 
 
 		 369 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 356 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>