More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0803 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0803  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 429 aa  822    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.916212  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0898  sensor histidine kinase  47.78 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0968  sensor histidine kinase  47.07 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.130754  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0924  sensor histidine kinase  46.37 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0402  sensory trasnduction histidine kinase  31.94 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0208594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0537  sensory trasnduction histidine kinase  44.19 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1874  ATP-binding region ATPase domain protein  33.44 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1558  histidine kinase  33.33 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.160407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  34.58 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  29.55 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 592 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  34.26 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 608 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 592 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  32.14 
 
 		 465 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 592 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  30 
 
 		 502 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 497 aa  97.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 584 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  25.97 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 446 aa  93.2  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 581 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 589 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1491  histidine kinase  34.58 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 584 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.253762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  23.98 
 
 		 526 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 763 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  26.27 
 
 		 501 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 763 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 364 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  27.31 
 
 		 397 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  27.42 
 
 		 581 aa  89.7  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 590 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 763 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 816 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  28.11 
 
 		 350 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.26 
 
 		 537 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  25.53 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 592 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  27.54 
 
 		 906 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.05 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.97 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.42 
 
 		 914 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.12 
 
 		 535 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  28.45 
 
 		 696 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 535 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0992  histidine kinase  30.23 
 
 		 462 aa  87  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 535 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  23.73 
 
 		 611 aa  86.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2179  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 587 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  23.36 
 
 		 387 aa  86.3  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  25.93 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 733 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  29.95 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  25.93 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 587 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  24.31 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  31.56 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.66 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 484 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  21.88 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.96 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  25.1 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  27.36 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  24.77 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  29.55 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  24.77 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  25.1 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 587 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  25.1 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1278  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00211916  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  25.1 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  28.21 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  26.24 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  24.77 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>