More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0479 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0441  pyruvate kinase  74.95 
 
 
480 aa  733    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.269718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1566  pyruvate kinase  75.16 
 
 
480 aa  736    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0479  pyruvate kinase  100 
 
 
483 aa  985    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0415  pyruvate kinase  75.37 
 
 
480 aa  734    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0248117  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1356  pyruvate kinase  59.17 
 
 
483 aa  597  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000703593  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0964  pyruvate kinase  59.34 
 
 
483 aa  587  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00587178  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0501  pyruvate kinase  59.67 
 
 
481 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.559295  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0630  pyruvate kinase  60.17 
 
 
482 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1635  pyruvate kinase  57.11 
 
 
484 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  45.24 
 
 
581 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.67 
 
 
584 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  42.36 
 
 
585 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  42.45 
 
 
585 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  42.36 
 
 
585 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.7 
 
 
494 aa  372  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  40.89 
 
 
582 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  40.89 
 
 
605 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  40.68 
 
 
485 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  40.43 
 
 
483 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  43.8 
 
 
578 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  41.1 
 
 
485 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  41.39 
 
 
586 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  42.98 
 
 
577 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  41.4 
 
 
580 aa  363  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  42.07 
 
 
580 aa  363  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  40.41 
 
 
596 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  39.79 
 
 
597 aa  361  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  43.78 
 
 
587 aa  359  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  39.59 
 
 
596 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  39.59 
 
 
596 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  41.1 
 
 
583 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  40.8 
 
 
583 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  42.47 
 
 
590 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  41.05 
 
 
592 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  41.05 
 
 
592 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  41.56 
 
 
585 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.19 
 
 
583 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  42.26 
 
 
588 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  39.87 
 
 
585 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  41.39 
 
 
471 aa  347  4e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  38.98 
 
 
594 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  42.92 
 
 
470 aa  342  8e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  40.97 
 
 
580 aa  342  9e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  39.75 
 
 
472 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  41.09 
 
 
472 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  41.26 
 
 
585 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  40.38 
 
 
601 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  39.62 
 
 
600 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0844  pyruvate kinase  39.71 
 
 
585 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  39.58 
 
 
580 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  40.93 
 
 
472 aa  339  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  39.96 
 
 
582 aa  339  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  40.84 
 
 
585 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  37.95 
 
 
476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  38.35 
 
 
474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  39.92 
 
 
585 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  38.49 
 
 
471 aa  336  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  40.42 
 
 
471 aa  335  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  40.79 
 
 
488 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2605  pyruvate kinase  38.91 
 
 
588 aa  334  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  39.62 
 
 
590 aa  335  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  39.67 
 
 
492 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  39.67 
 
 
492 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0882  pyruvate kinase  38.41 
 
 
589 aa  333  6e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.441073  hitchhiker  0.000000000000201084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  40.88 
 
 
482 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  38.27 
 
 
477 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  39.83 
 
 
587 aa  329  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  38.53 
 
 
589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1114  pyruvate kinase  37.18 
 
 
486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.679316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  37.89 
 
 
478 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  40.38 
 
 
479 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  38.82 
 
 
471 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  40.42 
 
 
474 aa  326  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  38.98 
 
 
471 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0342  pyruvate kinase  37.97 
 
 
467 aa  326  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  38.48 
 
 
477 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0351  pyruvate kinase  37.97 
 
 
467 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0288145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  38.61 
 
 
471 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  38.61 
 
 
471 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  37.78 
 
 
488 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  38.82 
 
 
471 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  39.24 
 
 
476 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  38.05 
 
 
477 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  41.49 
 
 
474 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  38.49 
 
 
479 aa  324  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  38.27 
 
 
477 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  38.48 
 
 
475 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  38.27 
 
 
477 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  39.41 
 
 
471 aa  323  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0562  pyruvate kinase  39.15 
 
 
585 aa  322  7e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  38.12 
 
 
484 aa  322  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  37.89 
 
 
470 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>