187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0037 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0037  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11950  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0612113  normal  0.0857463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0021  tRNA-Met  98.36 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16830  tRNA-Met  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0031  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0043725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0034  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0036  tRNA-Met  95.16 
 
 		 75 bp  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0039  tRNA-Met  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474012  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0032  tRNA-Met  94.92 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169141  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0023  tRNA-Met  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.013256 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0049  tRNA-Met  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0004  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0022  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0041  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0236723 
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0031  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06700  tRNA-Met  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13990  tRNA-Met  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314954  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0028  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.260556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0032  tRNA-Met  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366508  normal  0.496339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0028  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882337  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60320  tRNA-Met  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  89.83 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0039  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0052  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0246441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0022  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1973  hypothetical protein  91.3 
 
 		 318 bp  60  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0069  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0026  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.163788  normal  0.234084 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0018  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0043  tRNA-Met  88.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0021  tRNA-Met  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0036  tRNA-Met  85.53 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.572801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0038  tRNA-Met  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0013  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R35  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07470  tRNA-Met  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349913  normal  0.175912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0014  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0015  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0017  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0011  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0010  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0022  tRNA-Met  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.09062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0006  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0028  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0063  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  86.36 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0043  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0002  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.099087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0051  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.584124  normal  0.75185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0001  tRNA-Met  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.103849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0083  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456541  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0033  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0030  tRNA-Met  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0010  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00296143  hitchhiker  0.00854354 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0041  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102912  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0010  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>