32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2333 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  726    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  44.51 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  39.2 
 
 		 470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  33.74 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  35.22 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  32.97 
 
 		 514 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  33.98 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  39.21 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  33.5 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  38.29 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  33.23 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  37.5 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  35.55 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  33.15 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  33.15 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  33.15 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  30.15 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  31.11 
 
 		 384 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  32.8 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  31.12 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  34.01 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  28.85 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  28.93 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  31.73 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  31.81 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  34.92 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0453  hypothetical protein  32.91 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2253  hypothetical protein  27.87 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4045  hypothetical protein  52.38 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3671  hypothetical protein  31.54 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  43.37 
 
 		 2397 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  31.87 
 
 		 2851 aa  44.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>