108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11750 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11750  Sec-independent protein secretion pathway component  100 
 
 
319 aa  608  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2832  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  69.79 
 
 
245 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19840  Sec-independent protein secretion pathway component  61.9 
 
 
203 aa  96.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.87482  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.94 
 
 
207 aa  96.7  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.98 
 
 
122 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 
140 aa  63.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.28 
 
 
113 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40.74 
 
 
126 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.51 
 
 
88 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 
103 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.07 
 
 
96 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  40.74 
 
 
111 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  36.76 
 
 
104 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  38.46 
 
 
194 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.04 
 
 
197 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.5 
 
 
234 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 
146 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  38.18 
 
 
179 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  45.28 
 
 
87 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  41.51 
 
 
122 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 
139 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 
139 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  25 
 
 
231 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.44 
 
 
115 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.86 
 
 
214 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.85 
 
 
106 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.83 
 
 
92 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  40.74 
 
 
91 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  41.54 
 
 
136 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.67 
 
 
190 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 
203 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0753  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.29 
 
 
156 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  31.25 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.25 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  31.25 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  31.25 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  31.25 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  31.25 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  31.25 
 
 
182 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  31.25 
 
 
182 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  31.25 
 
 
182 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  31.25 
 
 
182 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  31.25 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  45.28 
 
 
91 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  45.28 
 
 
91 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.51 
 
 
90 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  31.25 
 
 
171 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  31.25 
 
 
182 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.5 
 
 
193 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  47.5 
 
 
130 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  43.4 
 
 
90 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  29.69 
 
 
179 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.75 
 
 
128 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.43 
 
 
155 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.36 
 
 
152 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  30.11 
 
 
95 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
88 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  44 
 
 
60 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.5 
 
 
208 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.79 
 
 
169 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  54.05 
 
 
84 aa  50.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  44.44 
 
 
125 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  45.65 
 
 
96 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  32.5 
 
 
88 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  30.83 
 
 
155 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.48 
 
 
189 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  40.74 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  29.35 
 
 
96 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  35 
 
 
89 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  43.48 
 
 
95 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.48 
 
 
96 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  37.04 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.48 
 
 
99 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
62 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  33.75 
 
 
88 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.48 
 
 
116 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.89 
 
 
64 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45427  predicted protein  33.33 
 
 
436 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45 
 
 
94 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  42.22 
 
 
59 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  38.89 
 
 
133 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  38.89 
 
 
229 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
66 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.1 
 
 
71 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  39.58 
 
 
67 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.65 
 
 
96 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  32.73 
 
 
184 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1020  Sec-independent protein translocase protein tatA, putative  44 
 
 
62 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  34.48 
 
 
91 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.65 
 
 
96 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  32.58 
 
 
137 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  34.57 
 
 
137 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  33.9 
 
 
77 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1210  twin-arginine translocation protein TatB  37.78 
 
 
173 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0211  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.76 
 
 
239 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.69 
 
 
167 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  32.76 
 
 
76 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  30.14 
 
 
162 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>