38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03150 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03150  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  381  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.223184  hitchhiker  0.0000000000000424002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  63.89 
 
 		 413 aa  243  8e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  45.51 
 
 		 427 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  45.76 
 
 		 435 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  43.5 
 
 		 423 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  44.38 
 
 		 383 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.42 
 
 		 409 aa  99  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  33.86 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  28.14 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  28.14 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  29.17 
 
 		 401 aa  71.2  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  31.75 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  30.59 
 
 		 436 aa  62  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  32.58 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  27.78 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  27.81 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  29.2 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  27.81 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  32.89 
 
 		 416 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  30.46 
 
 		 417 aa  53.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  28.08 
 
 		 425 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3120  hypothetical protein  27.59 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.239583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  23.56 
 
 		 442 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  24.52 
 
 		 391 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  26.98 
 
 		 437 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  26.88 
 
 		 400 aa  48.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 		 409 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 		 409 aa  48.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  29.01 
 
 		 439 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  25.14 
 
 		 425 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.02 
 
 		 386 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.85 
 
 		 406 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  22.1 
 
 		 446 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  25.67 
 
 		 437 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  32.47 
 
 		 404 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.17 
 
 		 400 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  20 
 
 		 445 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>