More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0047 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
331 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.21 
 
 
361 aa  517  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.63 
 
 
327 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.29 
 
 
347 aa  362  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.83 
 
 
325 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
348 aa  352  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.07 
 
 
310 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.76 
 
 
310 aa  322  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.94 
 
 
341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000165422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 
340 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.7 
 
 
338 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0104198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0898  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
338 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.57 
 
 
313 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
356 aa  265  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
356 aa  265  8e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1085  oligopeptide ABC transporter, permease  44.26 
 
 
338 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1263  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.26 
 
 
338 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
340 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1302  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.82 
 
 
338 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.793608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1340  oligopeptide ABC transporter, permease protein  44.54 
 
 
338 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1103  oligopeptide ABC transporter permease  44.54 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1079  oligopeptide ABC transporter, permease  44.54 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1193  oligopeptide ABC transporter permease protein  44.54 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0326029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1236  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.98 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.519507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4106  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.98 
 
 
338 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.39 
 
 
313 aa  260  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
314 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  43.62 
 
 
293 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  44.3 
 
 
302 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.04 
 
 
302 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  43.97 
 
 
300 aa  255  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 
300 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
299 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  42.5 
 
 
300 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0638  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  41.54 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
318 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.7223 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
309 aa  241  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
318 aa  239  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.29 
 
 
301 aa  238  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
319 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0184678  normal  0.258493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
305 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
304 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
280 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
280 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
293 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
301 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.69178  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
334 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
301 aa  226  4e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1583  oligopeptide ABC transporter permease OppC  40.13 
 
 
302 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1401  oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  40.13 
 
 
302 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1935  oligopeptide ABC transporter permease OppC  40.13 
 
 
302 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0740124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1878  oligopeptide ABC transporter permease OppC  40.13 
 
 
302 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.991183  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1872  oligopeptide ABC transporter permease protein OppC  40.13 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
302 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00582583  hitchhiker  0.00187492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.92 
 
 
305 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0337  oligopeptide transport system permease protein OppC  35.71 
 
 
349 aa  224  1e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0317514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
309 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
301 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
289 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0755  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, inner membrane subunit  40.41 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
280 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
308 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  42.32 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  39.07 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0230  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
334 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0187  oligopeptide ABC transporter permease  41.3 
 
 
334 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0186  oligopeptide ABC transporter permease protein  41.3 
 
 
334 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
304 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
300 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474615  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
300 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
377 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
334 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
296 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
300 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1479  ABC oligopeptide transporter, inner membrane subunit OppC  46.72 
 
 
379 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.230564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
379 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
379 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 
307 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
300 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39 
 
 
307 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0211  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
334 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  39.33 
 
 
307 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0207  oligopeptide ABC transporter, permease  39.68 
 
 
307 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  39 
 
 
307 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  39.33 
 
 
307 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5411  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
300 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
299 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2300  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
302 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0465  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.48 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
313 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
300 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  38.18 
 
 
303 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
303 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0535  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.48 
 
 
386 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>