More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3202 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3202  transcription elongation factor regulatory protein  100 
 
 		 161 aa  317  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2930  transcription elongation factor regulatory protein  67.92 
 
 		 158 aa  207  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2390  transcription elongation factor regulatory protein  56.25 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0124543  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5139  transcription elongation factor regulatory protein  54.37 
 
 		 160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276669  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1741  transcription elongation factor regulatory protein  56.25 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2845  GreA/GreB family elongation factor  54.09 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2146  transcription elongation factor regulatory protein  57.5 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2366  GreA/GreB family elongation factor  53.46 
 
 		 153 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.805703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1580  transcription elongation factor regulatory protein  54.72 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0460715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4333  GreA/GreB family elongation factor  57.23 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  0.881109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1165  transcription elongation factor regulatory protein  54.09 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5114  transcription elongation factor regulatory protein  56.25 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3833  GreA/GreB family elongation factor  53.37 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3876  transcription elongation factor GreA/GreB domain-containing protein  53.46 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131848  normal  0.0366089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4357  transcription elongation factor regulatory protein  53.46 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4186  GreA/GreB family elongation factor  53.46 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998737  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0558  transcription elongation factor GreA domain-containing protein  49.69 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0556  transcription elongation factor GreA domain-containing protein  49.06 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2707  GreA/GreB family elongation factor  47.8 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1206  GreA/GreB family elongation factor  52.8 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1137  GreA/GreB family elongation factor  42.42 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0401  transcription elongation factor, putative  42.26 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2011  putative transcription elongation factor  43.9 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0721  GreA/GreB family elongation factor  43.9 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.44423  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4873  GreA/GreB family elongation factor  37.65 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.772503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4508  GreA/GreB family elongation factor  40.97 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3408  GreA/GreB family elongation factor  39.38 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4601  transcription elongation factor GreB  38.36 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0707  GreA/GreB family elongation factor  38.78 
 
 		 165 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.975764  normal  0.0706669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4263  transcription elongation factor GreA/GreB  36.05 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0676  GreA/GreB family elongation factor  38.1 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0708  GreA/GreB family elongation factor  37.04 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4844  GreA/GreB family elongation factor  41.36 
 
 		 157 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.877006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0865  transcription elongation factor GreB  32.72 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.494541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2723  transcription elongation factor  34.76 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0950  transcription elongation factor GreB  32.72 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380314  hitchhiker  0.0000173092 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  41.84 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4332  transcription elongation factor GreB  32.8 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.313941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3150  GreA/GreB family elongation factor  34.43 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1871  transcription elongation factor GreB  31.18 
 
 		 213 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4110  transcription elongation factor GreB  32.85 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000102094  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0395  transcription elongation factor GreB  36.54 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0662581  normal  0.0531871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1756  GreA/GreB family elongation factor  53.85 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2091  transcription elongation factor GreB  31.52 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0520  transcription elongation factor GreB  32.68 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.525146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3044  transcription elongation factor GreB  32.73 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00484653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3010  transcription elongation factor GreB  31.52 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.998685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2653  transcription elongation factor GreB  31.52 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0303907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2119  GreA/GreB family elongation factor  53.85 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0820  transcription elongation factor GreB  31.52 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0909  transcription elongation factor GreB  33.73 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1959  transcription elongation factor GreB  31.52 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2023  transcription elongation factor GreB  31.33 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2944  transcription elongation factor GreB  31.52 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143322  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  34.85 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1105  GreA/GreB family elongation factor  34.71 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.340307  normal  0.981817 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1591  transcription elongation factor GreB  31.52 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000320355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3586  transcription elongation factor GreB  33.73 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687664  hitchhiker  0.00676969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2152  transcription elongation factor GreB  31.36 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000119957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0673  transcription elongation factor GreB  32.52 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0253655  normal  0.983843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1838  GreA/GreB family elongation factor  52.31 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  42.05 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01570  transcription elongation factor, putative  34.32 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808731  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3081  transcription elongation factor GreB  32.74 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0292072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0962  transcription elongation factor GreB  32.85 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00012209  normal  0.571045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0523  transcription elongation factor GreB  32.85 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000760648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1002  transcription elongation factor GreB  32.85 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0052225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2273  transcription elongation factor GreB  31.18 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2396  transcription elongation factor GreB  32.85 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0874  transcription elongation factor GreB  32.85 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0745968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0862  transcription elongation factor GreB  32.85 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000987565  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1753  GreA/GreB family elongation factor  31.39 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  48.61 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  39.8 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1370  transcription elongation factor GreB  35 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  32.19 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1652  GreA/GreB family elongation factor  63.27 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1332  GreA/GreB family elongation factor  30.72 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.294175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0165  transcription elongation factor GreB  32.07 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0859  transcription elongation factor GreB  30.59 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  39.25 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  31.91 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1950  transcription elongation factor GreB  30.59 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697488  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2470  transcription elongation factor GreB  31.36 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0253654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0339  GreA/GreB family elongation factor  34.57 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  35.34 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  32.59 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  39.8 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  32.59 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1494  transcription elongation factor GreB  31.43 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  38.6 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3307  transcription elongation factor GreB  30.26 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000320561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  45.83 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1778  transcription elongation factor GreB  35.66 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>