65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1972 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
238 aa  481  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
233 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  29.7 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 
198 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.58 
 
 
205 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.93 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  31.96 
 
 
188 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
200 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.4 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.4 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.4 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 
206 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.4 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.4 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.38 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 
222 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.78 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.44 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.6 
 
 
440 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.3 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  24.85 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  28.4 
 
 
196 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 
202 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
213 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  30.77 
 
 
203 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3846  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
194 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 
208 aa  42  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
220 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
223 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  30.77 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  30.77 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>