17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1563 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  504  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  46.03 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  30.66 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  24.48 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  24.3 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  23.27 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  23.51 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  31.16 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  24.51 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  25.98 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  23.51 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  27.54 
 
 		 229 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  26.21 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  31.11 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  24.15 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  23.13 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>