More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0868 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 
350 aa  690    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.57 
 
 
347 aa  549  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.86 
 
 
347 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00505613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.61 
 
 
354 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.65 
 
 
349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.09 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.4 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  65.05 
 
 
349 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.64 
 
 
344 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.77 
 
 
342 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.14 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.79 
 
 
349 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.43 
 
 
338 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.01 
 
 
338 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.58 
 
 
338 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.61 
 
 
337 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.54 
 
 
338 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.02 
 
 
337 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
336 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.79 
 
 
336 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.33 
 
 
330 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.6 
 
 
345 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.98 
 
 
353 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.92 
 
 
341 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.63 
 
 
335 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.03 
 
 
346 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.03 
 
 
346 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.92 
 
 
336 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.16 
 
 
353 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  59.6 
 
 
341 aa  418  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.24 
 
 
344 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.3 
 
 
541 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.61 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
333 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.78 
 
 
348 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
333 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
336 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
336 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
340 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
333 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 
348 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.28 
 
 
344 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
334 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 
334 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.17 
 
 
348 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.58 
 
 
340 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.82 
 
 
335 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.79 
 
 
335 aa  411  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.41 
 
 
345 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.08 
 
 
352 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.42 
 
 
333 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.3 
 
 
333 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.78 
 
 
348 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 
345 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.7 
 
 
350 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.36 
 
 
344 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 
336 aa  408  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.08 
 
 
339 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2234  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.09 
 
 
353 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2254  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.442395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2322  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.76 
 
 
321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.674048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.94 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2104  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.73 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1820  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.16 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2420  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00322281  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.52 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.7 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12840  Holliday junction DNA helicase, RuvB subunit  61.4 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.58 
 
 
350 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.73 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.4 
 
 
343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.27 
 
 
346 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 
334 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.96 
 
 
341 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 
336 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 
334 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0928  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.08 
 
 
354 aa  401  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.36 
 
 
363 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 
334 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1063  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.16 
 
 
343 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.8 
 
 
347 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2777  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.97 
 
 
351 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.928098  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.21 
 
 
348 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 
352 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.16 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.46 
 
 
334 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.03 
 
 
351 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 
355 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.21 
 
 
334 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.88 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.93 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2213  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.86 
 
 
346 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>