More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0425 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0425  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 390 aa  792    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3699  tyrosyl-tRNA synthetase  64.36 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0576  tyrosyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_541  tyrosyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.32758  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0601  tyrosyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 396 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00761156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1709  tyrosyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000941896  normal  0.172619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0442  tyrosyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 401 aa  391  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000185644  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000934164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0457  tyrosyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000997958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1368  tyrosyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0107166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3502  tyrosyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00208085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2348  tyrosyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 408 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0970  tyrosyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000274252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2810  tyrosyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0678103  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1490  tyrosyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3291  tyrosyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1695  tyrosyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00574764  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2880  tyrosyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396777  hitchhiker  0.000268729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2962  tyrosyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00936111  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3058  tyrosyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00597341  normal  0.0659405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1022  tyrosyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0241609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 403 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262104  normal  0.700315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0438  tyrosyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000725763  normal  0.0537593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1110  tyrosine--tRNA ligase  47.83 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000317082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2405  tyrosyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000233958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1315  tyrosyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05700  Tyrosyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3310  tyrosyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0899529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1182  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2971  tyrosyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 399 aa  362  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3822  tyrosyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 404 aa  362  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002596  tyrosyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000034927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4727  tyrosyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.964495  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1139  tyrosyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 403 aa  362  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.147435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1723  tyrosyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 398 aa  361  9e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03412  tyrosyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0405  tyrosyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000345962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3373  tyrosyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0228  tyrosyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1585  tyrosyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 410 aa  359  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0249853  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0271  tyrosyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 399 aa  358  7e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 412 aa  358  7e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000303004  normal  0.076359 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0545  tyrosyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 400 aa  358  9e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.725424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1128  tyrosyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0526409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1214  tyrosyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0935576  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1919  tyrosyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000583253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0886  tyrosyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000451813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08370  tyrosyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.464474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1237  tyrosyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1307  tyrosyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 395 aa  355  8.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00344765  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1356  tyrosyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1212  tyrosyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 398 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.513557  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1170  tyrosyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0435877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1247  tyrosyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0337224  normal  0.116936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3143  tyrosyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0863543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1104  tyrosyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0628  tyrosyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2206  tyrosyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0850  tyrosyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 399 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.508518  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0611  tyrosyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1949  tyrosyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1034  tyrosyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 413 aa  352  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141012  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0995  tyrosyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15334  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0476  tyrosyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1647  tyrosyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00531566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2333  tyrosyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2560  tyrosyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3769  tyrosyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 413 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 421 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3050  tyrosyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 398 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000057737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0417  tyrosyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 413 aa  349  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117344 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0588  tyrosyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 403 aa  349  5e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2033  tyrosyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0200  tyrosyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0743273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0683  tyrosyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483128  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0496  tyrosyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.182891  normal  0.219144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02330  tyrosyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 403 aa  348  7e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.083172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0611  tyrosyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 416 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.706339  normal  0.345444 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0477  tyrosyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4672  tyrosyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0387  tyrosyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0809  tyrosyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 399 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.00020616  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0876  tyrosyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  unclonable  0.00000000281136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0650  tyrosyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 413 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0577  tyrosyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 413 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0749  tyrosyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000050083  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0603  tyrosyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 413 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.780429  normal  0.696088 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0064  tyrosyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000240526  normal  0.291627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2700  tyrosyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 454 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3350  tyrosyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0699695  hitchhiker  0.0000481251 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2527  tyrosyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1123  tyrosyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2348  tyrosyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0459  tyrosyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000135795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0352  tyrosyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3927  tyrosyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000017019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0261  tyrosyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>