142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_R0070 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_R0070  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0059  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000543343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00054  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0016  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0073  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0066  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0078  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4697  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00274412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5067  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0018  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.268435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2997  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3531  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3271  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3267  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3205  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.582072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3192  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3372  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4154  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0729117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0004  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.382329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0105  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000116623  normal  0.0769122 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0012  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24410  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.437123  normal  0.656615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0013  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0096  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000621353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0018  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0042  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0023  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000161522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00298104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0660742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4986  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0053  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000840189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5674  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>