57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8039 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  71.79 
 
 		 77 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  73.08 
 
 		 77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  73.08 
 
 		 77 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 77 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 77 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  70.13 
 
 		 77 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  67.95 
 
 		 77 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1487  transcriptional regulator, AsnC family  75.64 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3289  AsnC family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 78 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  58.97 
 
 		 77 aa  97.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  62.82 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  56.41 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  59.21 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4217  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0684  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0675913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2086  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737881 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1782  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00773049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  42.25 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2809  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.419913 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1087  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0577  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0210  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  45.83 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0822  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1584  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00433651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0619  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.742984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0627  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1590  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.947785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2626  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.23982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4494  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 92 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1485  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0619  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 76 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3463  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  32.5 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>