19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6851 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6851  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000610958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8581  hypothetical protein  51.08 
 
 
292 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.386277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4078  hypothetical protein  37.35 
 
 
343 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00802232  normal  0.323258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6730  hypothetical protein  33.95 
 
 
329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0182171  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1985  hypothetical protein  32.48 
 
 
294 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00882852  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1695  hypothetical protein  33.45 
 
 
337 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00508626  normal  0.0395345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2715  hypothetical protein  32.54 
 
 
345 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.768605  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1143  hypothetical protein  34.16 
 
 
302 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0030  hypothetical protein  31.1 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2550  hypothetical protein  31.71 
 
 
337 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.753306  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1788  hypothetical protein  31.75 
 
 
343 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2778  hypothetical protein  31.11 
 
 
342 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5203  hypothetical protein  32.23 
 
 
306 aa  88.6  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4420  hypothetical protein  30.4 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597726  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2746  hypothetical protein  31.78 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327667  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2826  hypothetical protein  25 
 
 
332 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3664  hypothetical protein  26.11 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2057  hypothetical protein  28.46 
 
 
177 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0907  hypothetical protein  29 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>