292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6778 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
222 aa  438  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  44.22 
 
 
211 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.08 
 
 
223 aa  161  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
210 aa  148  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  41.7 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.37 
 
 
201 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.01 
 
 
215 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.94 
 
 
198 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0234  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.21 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.5 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.08 
 
 
207 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.76 
 
 
218 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.79 
 
 
215 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.32 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.18 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.19 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.19 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  44.19 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.84 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.83 
 
 
201 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.6 
 
 
182 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4286  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  41.48 
 
 
217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  41.92 
 
 
199 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
197 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.45 
 
 
233 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.57 
 
 
199 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
216 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.5 
 
 
202 aa  104  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.24 
 
 
216 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.23 
 
 
213 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.4 
 
 
222 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.37 
 
 
202 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.23 
 
 
213 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.89 
 
 
212 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.12 
 
 
232 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.57 
 
 
198 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.12 
 
 
232 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  41.42 
 
 
202 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.02 
 
 
213 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.57 
 
 
198 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  40.35 
 
 
203 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  40.35 
 
 
203 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  41.82 
 
 
202 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.46 
 
 
215 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.07 
 
 
239 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  40.49 
 
 
203 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.76 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35 
 
 
210 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.34 
 
 
204 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
198 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.1 
 
 
204 aa  99  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  40.46 
 
 
202 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.76 
 
 
198 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.95 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.95 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.16 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.16 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  37.04 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.12 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  40.59 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.43 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.16 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.59 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  37.87 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.86 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.43 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.79 
 
 
203 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.42 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.76 
 
 
198 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.3 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  37.5 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.82 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  41.21 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.16 
 
 
198 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  30 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 
204 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.8 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.15 
 
 
199 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.46 
 
 
207 aa  92  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.78 
 
 
209 aa  92  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  36.49 
 
 
202 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.27 
 
 
202 aa  91.7  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.8 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.76 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.84 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.22 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  36.75 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  36.75 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.75 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.09 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.75 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  36.75 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  36.75 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.75 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.75 
 
 
198 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>