24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6700 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  34.55 
 
 		 1611 aa  65.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  36.07 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  33.02 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  27.52 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1526 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  29.09 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  31.17 
 
 		 2159 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  33.33 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  28.85 
 
 		 413 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  29.82 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  34.21 
 
 		 431 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  28.57 
 
 		 374 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.63 
 
 		 1016 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.63 
 
 		 1016 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  29.73 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  29.41 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  30.89 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  26.55 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.7 
 
 		 1363 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  26.23 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  30 
 
 		 520 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>